研究者らは、蜂蜜から抽出した環境DNA（eDNA）を用いて、ヨーロッパクリ（Castanea sativa Miller）の集団遺伝情報をマイクロサテライト解析により取得できることを示しまし…

研究者らは、蜂蜜から抽出した環境DNA（eDNA）を用いて、ヨーロッパクリ（Castanea sativa Miller）の集団遺伝情報をマイクロサテライト解析により取得できることを示しました。本研究は、2019年と2020年にイタリア北部のエミリア＝ロマーニャ、フリウリ＝ヴェネツィア・ジュリア、トレンティーノ＝アルト・アディジェ、ヴェネトの4地域から採取された21の蜂蜜サンプルを対象としています。各サンプルは約200グラムの蜂蜜を含んでいます。

蜂蜜サンプルからはCTAB法を用いてDNAを抽出し、不純物除去の精製工程を経ました。抽出したeDNAは、Castanea sativaに特異的な5つのマイクロサテライト座位（CsCAT2、CsCAT14、CsCAT17、EMCs2、EMCs15、EMCs22）を標的にPCR増幅されました。PCR産物はキャピラリー電気泳動とソフトウェアを用いてアレルサイズと頻度を解析しました。

解析の結果、21の蜂蜜サンプルから35の異なるアレルが検出され、アレルサイズは79～229塩基対の範囲でした。座位あたりの平均アレル数は3.99でした。いくつかの座位ではより多くのアレルが観察され、蜂蜜由来のeDNAから良好な遺伝的多様性が検出可能であることが示されました。集団の遺伝構造はFST統計、UPGMAクラスタリング、主成分分析（PCA）により評価され、調査地域のクリ集団間で低いが有意な遺伝的分化が認められました。

ペアワイズFST値は、トレンティーノ＝アルト・アディジェとヴェネトの集団間で最も大きな分化を示し、フリウリ＝ヴェネツィア・ジュリアとヴェネト間では最も小さな分化が観察されました。マンテル検定により、遺伝的距離と地理的距離の間に有意な相関が認められ、距離隔離が支持されました。