Обновление исследований: Генетика популяций азиатского садового жука

Аспирант лаборатории Тилмона Адриан Пекарчик получил преддокторскую стипендию USDA AFRI EWD для исследования азиатского садового жука (АСЖ), Maladera castanea, ежегодного вида белых личинок, который был введен в США в 1921 году и распространился как минимум на 25 штатов и 2 канадские провинции. Исторически он был вредителем газонных трав и декоративных растений, однако за последние 10 лет АСЖ стал новым вредителем полевой кукурузы в Индиане, Мичигане и Огайо. Личинки, питающиеся корнями сеянцев весной, вызывают задержку роста, увядание, обесцвечивание и гибель растений. Высокая плотность личинок приводит к значительным потерям посевов, превышающим 40%. Интересно, что популяции АСЖ только недавно начали заражать полевые культуры и только в районе Великих озер, несмотря на их широкое распространение и долгую историю в США. Эти заражения локализованы в песчаных почвах, характерных для этого триштатного региона. Мы предполагаем, что эти жуки составляют генетически отличную популяцию и предлагаем использовать молекулярные генетические инструменты для сравнения генетической структуры среди популяций АСЖ в Северной Америке. Это служит долгосрочной целью понять, почему АСЖ стал новым вредителем. Наши цели заключаются в том, чтобы (1) разработать молекулярные маркеры для АСЖ и (2) оценить популяции Северной Америки на предмет вариаций, специфичных для среды обитания и/или географических вариаций. Мы предлагаем новый подход, который использует секвенирование фрагментов, амплифицированных по специфическим локусам (SLAF-seq), для идентификации полиморфизмов однонуклеотидов (SNP) для АСЖ. Этот проект вписывается в программу USDA AFRI по образованию и развитию рабочей силы в области здоровья растений и производства и растительных продуктов, поскольку ассоциированные с хозяином генотипы могут помочь нам предсказать популяции, находящиеся под угрозой будущих заражений. Кроме того, эти инструменты позволят проводить будущие исследования АСЖ.